現在は臨済宗妙心寺派に属し「とこなげ山」あるいは「眼病」に霊験あらたかな寺として親しまれています。
　寺伝によると大同二年（８０７年）弘法大師の開創といわれ、遣唐使として唐に渡り、密教の奥義を伝授された大師が帰国に際し、本国に向かって「独鈷（とっこ）」を天に投げたところ白雲を引いて飛び去ったといいます。帰国後その行方を奈良の 春日神社にうかがい「丹波国佐伯の庄山内村の北峰、娑婆山の松の枝にかかっている」との神託により、白鹿に導かれて、この地に来られたということです。
　以来この地を「鹿谷（ろくや）」山号を「獨鈷抛山（とこなげさん）」十一面千手観音（大師一刀三礼の作）を安置するので「千手寺（せんじゅじ）」というよ うになりました。
　当寺は創建後藤原時代に焼失し建長寺の止菴和尚が復興し真言宗から臨済宗に移りました。その後、天正五年（１５７７年）にも兵火にかかり、妙心寺の禅岩和尚が 再興して妙心寺派に属するようになりました。